1、本次系列课程共三个专题，专题一、三采用腾讯会议在线直播的形式，课后提供无限次回放视频。专题二采用北京线下授课的形式，面对面教学，与老师及时进行沟通（线下这个也有录播回放）。所有专题均建立永不解散的课程群，长期互动答疑，学员学完后可以继续与专业老师同学交流问题，巩固学习内容，从而更好地满足学员不同方面的论文及实际科研工作需求；

2、专题一课程带您一步步实操学习蛋白结构分析、同源建模、虚拟筛选、分子对接（半柔性、柔性对接、蛋白-蛋白、蛋白-多肽、酶蛋白-配体、核酸-小分子、共价对接）、药效团模型、定量构效关系、碎片化药物设计、Gromacs 分子动力学模拟与结果分析，并以实例讲解与练习为主，达到即学即用效果，帮助学员系统掌握计算机辅助药物设计技术，助力学术研究；

3、专题二课程以Rosetta软件为基础，以实例讲授和练习为主。依次讲授Rosetta软件基础、蛋白质结构viewer、结构扰动与结构优化、蛋白质复合物预测、抗体抗原模型处理与对接、SSD和MSD设计、 CartisenDDG 突变扫描、RosettaScript开发流程、序列与结构设计、从头蛋白质设计等的操作等多个内容。

4、专题三课程通过基础入门+进阶实例演练的讲授思路，从初学及应用研究角度出发，带大家实战演练机器学习在多组学整合分析中的数据处理、预测模型以及生物学意义阐述等，助力大家掌握多种机器学习算法模型的构建以及在多组学联合分析在肿瘤及慢性病中的实际应用，并介绍当下深度学习算法高维组学数据处理，生物网络挖掘的前沿方法，最后以论文复现讲授单细胞组学论文的常用图表制作、细胞差异分析、细胞注释（自动与手动）、蛋白-蛋白相互作用网络构建与可视化，助力于研究创新机器学习算法解决生物学及临床疾病问题与需求。

简略大纲（详情请打开文末PDF链接查阅原文）：

专题课程一：CADD蛋白结构分析、虚拟筛选、分子对接（蛋白-蛋白、蛋白-多肽）

生物分子互作基础；蛋白数据库；蛋白结构分析；同源建模；小分子构建；小分子化合物库；生物分子相互作用Ⅰ；生物分子相互作用II；虚拟筛选；小分子格式转换；答疑；拓展对接使用场景（上）；拓展对接使用场景（下）；基于碎片药物设计；构效关系分析；分子动力学模拟；答疑。

Rosetta从头蛋白抗体设计、结构优化及在药物研发中的应用（线下课程）

主要知识点

1 蛋白质折叠与结构预测简介

    1\.1        主链二面角与二级结构

    1\.2        侧链堆积与三级结构

2 蛋白质设计简介

    2\.1        蛋白质设计的分类及应用

3 Pose/mover/scorefunction

4 LINUX 入门命令

    4\.1        用户属组及权限 目录文件属性

    4\.2        LINUX基础命令 环境变量

    4\.3        shell常用命令练习

    4\.4        conda介绍

5 Minmover, MC Mover, Fastrelax mover

    5\.1 Movemap

6 RosettaScript组成和要素

    6\.1 Filter ResidueSelector

TaskOperation

    6\.2 DSSP/Disulfidize Mover

第二天

主要知识点

7 Translat和rotation mover

    7\.1        Low resolution的全局搜索

    7\.2        High resolution的精细调整

    7\.3        FoldTree

8 抗体结构文件的处理

    8\.1        PyIgClassify

    8\.2        抗体抗原对接模型

    8\.3        CDR区优化

    8\.4        Framework区优化

案例实践：Ø SSD和MSD设计任务

9 序列与结构设计

    9\.1        Input和Output flags控制输入输出

    9\.2        CleanAtom结构预处理

    9\.3        ROSETTACLASH.LOG和   RosettaCommons

    9\.4        ResFile等辅助文件

    9\.5        小改中改与大改

    9\.6        练习答疑

案例实践：Ø FastDesign设计任务

专题课程三：集成多组学数据的机器学习在生物医学中的应用专题

机器学习及生物组学基础；

赠送预习视频；

python基础；

赠送预习视频；

生物组学大数据预处理与探索分析；

经典机器学习模型；

及多组学应用；

深度学习在组学数据的应用；

(入门及实践)；

进阶教学大纲；

多组学联合分析，阐明疾病分子机制（入门及实战）；

深度学习神经网络进阶(入门及实践)；

深度学习在组学数据药物发现的应用 (入门及实践)；

AI+Science；

经典案例论文研究（论文图表复现）。

完整大纲链接（现在网上有很多恶意链接，如果怕被骗可以搜微信公众号：“科研软件大合集”查阅，或者直接加招生老师微信：“13784334157”了解）：

【腾讯文档】rosetta 蛋白抗体设计、计算机辅助药物设计、机器学习集成多组学系列专题2023.3.23

https://docs.qq.com/pdf/DTXRITVdob0drU0Va

主办方为：北京软研国际信息技术研究院；

承办方为：互动派（北京）教育科技有限公司